So, nun hab ich endlich mal etwas Zeit

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Erst mal vorneweg: Es ist verdammt schwer, so etwas einzuschätzen, schon gar, wenn man das Tier nicht selbst kennt und nur so wenig weiß. Daher kann ich nicht mehr machen, als ein paar Ideen zu liefern, was los sein könnte.
Es gibt verschiedene Möglichkeiten, warum ein Kaninchen aggressiv reagiert. Kaninchen sind Individuen, manche sind aggressiver als andere.
Aggressionen können „charakterbedingt“ sein, aber auch durch Stress hervorgerufen werden. Wobei das eine natürlich auch immer mit dem anderen zusammenhängt / zusammenhängen kann.
Zuerst zum Stress. Ein Tier hat verschiedene Möglichkeiten, mit Stress umzugehen. Viele suchen sich ein Ventil, um Stress abzulassen. Dass sind nicht selten Aggressionen.
Die Lösung des Problems wäre in diesem Fall, den Stressfaktor ausfindig zu machen und zu entfernen.
Vielleicht hängt es mit den Jungtieren zusammen, die immer mehr „Flüge“ werden? Kannst du da zeitlich irgendeinen Zusammenhang sehen?
Auch Schmerzen können aggressives Verhalten auslösen. Was hat der Tierarzt alles untersucht? Hat er sie nur angesehen oder wurde genauere Untersuchungen durchgeführt?
Dazu kommt noch, dass dein Kaninchen sehr energiehaltige Nahrung (die je nach Art des TroFus theoretisch auch zu Bauchschmerzen führen könnten) bekommt. Braucht es die überhaupt?
Wie viel bewegt sie sich? Beschäftigst du sie oder bekommt sie „nur“ Auslauf?
Wobei bei deinem Kaninchen noch ganz andere Faktoren dazukommen. Züchter berichten oft, dass Weibchen, die einmal Junge hatten, ein ganz anderes, teilweise aggressiveres und aufdringlicheres Verhalten an den Tag leben als solche, die dies nie erlebt haben.
Allerdings hat sie im Moment ja noch ihre Jungen.
Kaninchen haben oft ein ausgeprägtes Revierverhalten. Revierverteidigung könnte also auch ein solches Verhalten auslösen.
Sollte es das sein, muss dein Kaninchen lernen, dass es dich im Revier zu akzeptieren hat.
Sie könnte aber auch der Meinung sein, dass ihr in der „Rangordnung“ unter ihr steht und gefällst dort zu sein habt, wo sie will (bzw. nicht dort, wo sie nicht will).
Bevor man aber in Richtung „Dominanzproblem“ geht, sollte man erst mal abklären, ob es nicht andere Faktoren sind. Nicht, dass man dem Tier „Unrecht“ tut...
Beschreib mal ihre Körperhaltung. Wie standen sie Ohren? Wirkte sie angespannt? Kam sie zögerlich auf dich zu?
Hat sie dir nur gedroht, als du in den Käfig gelangt hast, oder hat sie dich angegriffen? Wirkte sie dabei nervös?